संरचना और भवन नालंदा विश्वविद्यालय का परिसर बहुत ही विशाल और सुंदर था। इसमें नौ विशालकाय पुस्तकालय थे जिनमें से तीन प्रमुख पुस्तकालय थे – रत्नसागर, रत्नोदधि और रत्नरंजक। यहाँ पर 10,000 से अधिक छात्र और 2,000 शिक्षक रहते थे। विश्वविद्यालय का पूरा परिसर एक शहर जैसा था जिसमें अनेक मठ, मंदिर, और शिक्षण कक्ष थे।

शिक्षण प्रणाली नालंदा विश्वविद्यालय में शिक्षण की पद्धति अत्यंत उन्नत और व्यवस्थित थी। यहाँ पर प्रवेश परीक्षा पास करने के बाद ही छात्रों को प्रवेश मिलता था। छात्रों को अनेक विषयों में विशेषज्ञता हासिल करने का अवसर मिलता था और शिक्षकों का ज्ञान अद्वितीय था। यह विश्वविद्यालय न केवल भारत बल्कि पूरे एशिया में शिक्षा का प्रमुख केंद्र था।

पतन और विनाश 12वीं शताब्दी में बख्तियार खिलजी के आक्रमण के बाद नालंदा विश्वविद्यालय को भारी नुकसान हुआ। उसने यहाँ के पुस्तकालयों को जलाकर नष्ट कर दिया और शिक्षकों तथा छात्रों को मार डाला। इस आक्रमण के बाद नालंदा विश्वविद्यालय का पतन शुरू हो गया और यह महान शैक्षणिक संस्थान इतिहास के पन्नों में समा गया।